У каждого чипа (транспондера) есть свой уникальный номер (ID). При включении зажигания блок иммобилайзера считывает ID ключа, находящегося в замке зажигания, и сравнивает с ID, записанными в самом блоке. При отсутствии рабочего чип-ключа (т.е. ID которого записан в блоке иммобилайзера) запуск автомобиля будет невозможен. В зависимости от марки и модели автомобиля будет заблокирована одна из электрических цепей двигателя (зажигание, стартер, топливный насос и др.).

Современные модели иммобилайзеров обычно не имеют отдельного блока управления, а является частью другого блока автомобиля, что значительно повышает защищенность системы.